總 期 數(shù)：52 期
辦 學(xué) 歷 史：16 年(2002 年-2017 年)
開(kāi) 班 時(shí) 間：2017 年 8 月 18 日-8 月 25 日(18 日為全天報(bào)到日，19 日開(kāi)始上課)
上 課 地 點(diǎn)：杭州 浙江大學(xué)華家池校區(qū)
隨著眾多生物基因組測(cè)序項(xiàng)目的完成，生物學(xué)數(shù)據(jù)正在加速度增長(zhǎng)。如何科學(xué)地分析和注釋這些高通量數(shù)據(jù)，已成為生物學(xué)工作者急需學(xué)習(xí)和解決的問(wèn)題。
浙江大學(xué)「基因組科學(xué)」研習(xí)班邀請(qǐng)北京基因組所于軍教授、胡松年教授為您講授基因組學(xué)基礎(chǔ)知識(shí)和前沿進(jìn)展、基因轉(zhuǎn)錄組的測(cè)定及分析、二代測(cè)序等實(shí)驗(yàn)技術(shù)的關(guān)鍵事項(xiàng);浙江大學(xué)楊軍教授、陳銘教授等講解系統(tǒng)生物學(xué)及高通量分析研究方法和思路。
浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班多次獲得浙江大學(xué)優(yōu)秀項(xiàng)目創(chuàng)新獎(jiǎng)，目前已舉辦 51 期，學(xué)員來(lái)自全國(guó) 30 余個(gè)省市，累計(jì)培訓(xùn)學(xué)員 5100 余名。每次研習(xí)班不乏教授、博導(dǎo)參加，更受到博士后、碩博生等年輕學(xué)者的青睞。
他們中有一些帶著課題或問(wèn)題前來(lái)交流和聯(lián)系，不少學(xué)員通過(guò)本研習(xí)班建立了長(zhǎng)期協(xié)作關(guān)系，共同申請(qǐng)國(guó)家 973、863 課題，共同發(fā)表論文，其中不少優(yōu)秀的研究成果，已在 SCI 期刊上發(fā)表。
一、浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班上課內(nèi)容
上課內(nèi)容涵蓋「基因組學(xué)—蛋白質(zhì)組學(xué)—系統(tǒng)生物學(xué)」的研究方法、技術(shù)思路、前沿進(jìn)展及其在各生物學(xué)科中的應(yīng)用。
浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班核心課程包括：
1. 基因組的比較研究、DNA 測(cè)序技術(shù)原理與進(jìn)展(講課人：于 軍 教授)
2. 轉(zhuǎn)錄組的測(cè)定與分析、大規(guī)模測(cè)序方法及應(yīng)用、微生物基因組學(xué)、基因組學(xué)與精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)(講課人：胡松年教授)
3. 系統(tǒng)生物學(xué)建模分析及高通量分析技術(shù)應(yīng)用(講課人：楊軍、陳銘教授等)
4. 蛋白質(zhì)組學(xué)概論及應(yīng)用(講課人：鐘伯雄教授)
二、浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班上機(jī)內(nèi)容
上機(jī)實(shí)習(xí)課采用 「跟我學(xué)」方式，學(xué)習(xí)實(shí)踐各類(lèi)基礎(chǔ)生物信息學(xué)軟件，每人一臺(tái) PC 機(jī)跟著大屏幕一步步學(xué)會(huì)基因組、蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析的基本方法。
浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班主要內(nèi)容如下：
實(shí)習(xí)一： 基因組數(shù)據(jù)注釋和功能分析
通過(guò)序列比對(duì)工具 BLAST 的學(xué)習(xí)，了解基因功能注釋的原理;介紹多序列聯(lián)配工具 ClustalX 及分子進(jìn)化分析軟件 MEGA4，掌握系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)繪制的基本方法，認(rèn)識(shí)基因復(fù)制在進(jìn)化上的功能;學(xué)習(xí)基因序列分析常用的數(shù)據(jù)庫(kù)和軟件。
實(shí)習(xí)二： 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
介紹轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的基本流程及其原理;通過(guò)對(duì) tophat、cufflinks、R 等轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析工具的介紹及演示，了解基于二代測(cè)序數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)錄組分析流程及常用分析方法; 利用 kegg、GOstat、DAVID 等在線工具挖掘轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的生物學(xué)意義。
實(shí)習(xí)三：系統(tǒng)生物學(xué)軟件實(shí)習(xí)-----網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)顯示與分析
利用 Cytoscape 系統(tǒng)生物學(xué)分析軟件，分析蛋白-蛋白相互作用，展示分子網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)，并與基因表達(dá)等數(shù)據(jù)整合。
實(shí)習(xí)四：蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能分析
從數(shù)據(jù)庫(kù)搜索感興趣的蛋白質(zhì)氨基酸序列開(kāi)始，接著對(duì)蛋白質(zhì)基本理化性質(zhì)、二級(jí)結(jié)構(gòu)、和三維空間結(jié)構(gòu)和序列模體進(jìn)行分析，預(yù)測(cè)目標(biāo)蛋白的生物功能。
實(shí)習(xí)五： 蛋白質(zhì)組質(zhì)譜分析
使用 X!Tandem、Mascot、Sequest 等軟件鑒定蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)，將質(zhì)譜結(jié)果匹配到蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)鑒定蛋白;使用 TPP 軟件包進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析和優(yōu)化檢索結(jié)果練習(xí)。
三、浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班培訓(xùn)對(duì)象
1. 無(wú)生物信息學(xué)背景，希望了解生物信息學(xué)的學(xué)員;
2. 計(jì)劃開(kāi)展各類(lèi)組學(xué)研究的科研人員;
3. 已有組學(xué)數(shù)據(jù)需了解分析方法的研究人員;
4. 有志從事生物信息學(xué)相關(guān)工作的學(xué)生或者技術(shù)人員。
四、浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班報(bào)名方法
若有參加意向，請(qǐng)直接將回執(zhí)發(fā)至 genetrain@zju.edu.cn，我們會(huì)即刻回函并在浙江大學(xué)繼續(xù)教育系統(tǒng)錄入，待排定課表后發(fā)給您詳細(xì)課程表。待您再次確認(rèn)后，發(fā)給您報(bào)到通知并排定上機(jī)號(hào)。培訓(xùn)結(jié)束，發(fā)放浙江大學(xué)繼續(xù)教育證書(shū)。(尚有少量名額，請(qǐng)盡快報(bào)名)
五、浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班教材 "DNA 和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)分析工具」(第三版)， 薛慶中等編著，科學(xué)出版社出版 2012 年 6 月發(fā)行。會(huì)務(wù)組提供。
聯(lián)系方式???? ?聯(lián) 系 人：代成林 18757558672?
電話：0571-88206579
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